Chemical elements
  Bromine
    Isotopes
    Energy
    Production
    Application
    PDB 101d-1f5m
    PDB 1f6j-1kdh
    PDB 1kfo-1o3l
    PDB 1o5m-1to3
    PDB 1uhj-1zpz
    PDB 1zw9-2fkk
      1zw9
      238d
      242d
      276d
      277d
      278d
      288d
      2a4t
      2a9w
      2af6
      2ag6
      2anr
      2ao5
      2avj
      2awd
      2awe
      2awz
      2ax9
      2az0
      2az2
      2b4g
      2b63
      2bhe
      2bu1
      2bvl
      2byd
      2c68
      2c69
      2cej
      2civ
      2cix
      2ciy
      2ciz
      2d2c
      2d6b
      2dgl
      2dlj
      2e4i
      2ewf
      2ez0
      2f4g
      2f5m
      2fcc
      2fcv
      2fcx
      2fcy
      2fcz
      2fd0
      2fe8
      2fkk
    PDB 2fpr-2j9m
    PDB 2ja5-2qfe
    PDB 2qgd-2wb9
    PDB 2wbb-3biy
    PDB 3bm9-3eki
    PDB 3en9-3hvo
    PDB 3hzw-3lbz
    PDB 3ld5-3ot3
    PDB 3oyp-4de3
    PDB 4dey-9est

Bromine in the structure of Novel Bromate Species Trapped Within A Protein Crystal (pdb 2d6b)






The binding sites of Bromine atom in the structure of Novel Bromate Species Trapped Within A Protein Crystal (pdb code 2d6b). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Bromine atom.
The 2d6b structure was solved by J.ONDRACEK, J.R.MESTERS, with X-Ray Crystallography technique, brief refinement statistics is given in the table below:
Resolution (A)8.0-1.2
Space groupP43212
a (A)77.210
b (A)77.210
c (A)38.191
alpha (°)90.00
beta (°)90.00
gamma (°)90.00
Rfactor (%)18.2
Rfree (%)21.3


Bromine Binding Sites:

Bromine binding site 1 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 1 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 1 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1031, A: Hoh1155, A: Hoh1162, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1031, A: Hoh1152, A: Hoh1159, A: Hoh1284, A: Hoh1288, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1150, A: Hoh1157, A: Hoh1266, A: Hoh1269, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1144, A: Hoh1151, A: Hoh1254, A: Hoh1257, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1143, A: Hoh1150, A: Hoh1246, A: Hoh1249, A: Hoh1293, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1143, A: Hoh1237, A: Hoh1239, A: Hoh1267, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1141, A: Hoh1227, A: Hoh1246, A: Hoh1268, A: Hoh1289, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1140, A: Hoh1224, A: Hoh1240, A: Hoh1258, A: Hoh1271, A: Hoh1274, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1140, A: Hoh1224, A: Hoh1236, A: Hoh1250, A: Hoh1259, A: Hoh1262, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1026, A: Hoh1140, A: Hoh1224, A: Hoh1235, A: Hoh1245, A: Hoh1252,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Hoh10313.25
BrO A:Hoh11553.90
BrO A:Hoh11623.95
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Hoh10313.25
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90
BrO A:Gly673.16
BrC A:Gly673.85
BrCA A:Gly674.77
BrN A:Arg684.31
BrC A:Arg684.64
BrCA A:Arg684.28
BrN A:Thr694.51
BrC A:Thr694.81
BrN A:Pro704.36
BrCB A:Pro704.48
BrCD A:Pro704.52
BrCG A:Pro704.16
BrCA A:Pro704.24
BrO1 A:2021311.53
BrBR A:2021310.00
BrO2 A:2021311.60
BrO3 A:2021311.57
BrO1 A:2021324.32
BrBR A:2021323.68
BrO2 A:2021323.36
BrO A:Hoh10263.90

interactive model:


Bromine binding site 2 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 2 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 2 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1033, A: Hoh1046, A: Hoh1230, A: Hoh1245, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1033, A: Hoh1046, A: Hoh1224, A: Hoh1239, A: Hoh1288, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1032, A: Hoh1045, A: Hoh1217, A: Hoh1231, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1032, A: Hoh1045, A: Hoh1223, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1032, A: Hoh1045, A: Hoh1220, A: Hoh1293, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1032, A: Hoh1045, A: Hoh1213, A: Hoh1267, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1032, A: Hoh1045, A: Hoh1204, A: Hoh1246, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1032, A: Hoh1045, A: Hoh1202, A: Hoh1240, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1032, A: Hoh1045, A: Hoh1202, A: Hoh1236, A: Asn65, A: Gly67, A: Arg68, A: Thr69, A: Pro70, A: Gly71, A: Ser72, A: 202131, A: 202132, A: Hoh1010, A: Hoh1012, A: Hoh1026, A: Hoh1032, A: Hoh1045, A: Hoh1202, A: Hoh1235,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrO A:Hoh10333.98
BrO A:Hoh10463.93
BrO A:Hoh12304.44
BrO A:Hoh12454.46
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrO A:Hoh10333.98
BrO A:Hoh10463.93
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09
BrOD1 A:Asn654.31
BrO A:Gly674.60
BrN A:Gly674.57
BrC A:Gly674.20
BrCA A:Gly674.31
BrN A:Arg684.37
BrC A:Arg684.87
BrO A:Thr692.97
BrN A:Thr693.85
BrCB A:Thr694.80
BrC A:Thr693.52
BrCA A:Thr694.25
BrN A:Pro704.10
BrC A:Pro704.69
BrCA A:Pro704.10
BrN A:Gly714.56
BrN A:Ser724.68
BrCB A:Ser724.91
BrOG A:Ser723.85
BrBR A:2021313.68
BrO2 A:2021313.04
BrO3 A:2021313.92
BrO1 A:2021321.72
BrBR A:2021320.00
BrO2 A:2021321.55
BrO3 A:2021321.61
BrO A:Hoh10104.44
BrO A:Hoh10124.08
BrO A:Hoh10263.09

interactive model:


Bromine binding site 3 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 3 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 3 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 3 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1039, A: Hoh1182, A: Hoh1206, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1039, A: Hoh1178, A: Hoh1201, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1038, A: Hoh1175, A: Hoh1291, A: Hoh1294, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1038, A: Hoh1168, A: Hoh1270, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1038, A: Hoh1167, A: Hoh1262, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1038, A: Hoh1166, A: Hoh1247, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1038, A: Hoh1163, A: Hoh1233, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1038, A: Hoh1161, A: Hoh1229, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1038, A: Hoh1161, A: Hoh1228, A: Lys1, A: Gln41, A: 202133, A: Hoh1005, A: Hoh1038, A: Hoh1161, A: Hoh1228,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrO A:Hoh10393.31
BrO A:Hoh11824.45
BrO A:Hoh12064.77
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrO A:Hoh10393.31
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44
BrN A:Lys14.17
BrCA A:Lys14.58
BrNE2 A:Gln413.76
BrCD A:Gln414.76
BrO1 A:2021331.76
BrBR A:2021330.00
BrO2 A:2021331.41
BrO3 A:2021332.03
BrO A:Hoh10054.44

interactive model:


Bromine binding site 4 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 4 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 4 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 4 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1047, A: Hoh1104, A: Hoh1168, A: Hoh1224, A: Hoh1241, A: Hoh1293, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1047, A: Hoh1103, A: Hoh1165, A: Hoh1218, A: Hoh1235, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1046, A: Hoh1102, A: Hoh1163, A: Hoh1212, A: Hoh1227, A: 1299, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1046, A: Hoh1102, A: Hoh1157, A: Hoh1205, A: Hoh1219, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1046, A: Hoh1102, A: Hoh1156, A: Hoh1203, A: Hoh1216, A: Hoh1280, A: 1304, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1046, A: Hoh1102, A: Hoh1155, A: Hoh1199, A: Hoh1274, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1046, A: Hoh1101, A: Hoh1153, A: Hoh1191, A: Hoh1253, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1046, A: Hoh1101, A: Hoh1152, A: Hoh1189, A: Hoh1246, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1046, A: Hoh1101, A: Hoh1152, A: Hoh1189, A: Hoh1240, A: Hoh1278, A: Gly4, A: Arg5, A: Cys6, A: Glu7, A: 202134, A: Hoh1046, A: Hoh1101, A: Hoh1152, A: Hoh1189, A: Hoh1266,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Hoh10473.98
BrO A:Hoh11043.55
BrO A:Hoh11682.81
BrO A:Hoh12244.13
BrO A:Hoh12413.97
BrO A:Hoh12934.49
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Hoh10473.98
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61
BrO A:Gly44.91
BrC A:Gly44.24
BrCA A:Gly44.16
BrN A:Arg54.03
BrCB A:Arg54.94
BrC A:Arg54.62
BrCA A:Arg54.71
BrN A:Cys63.61
BrCB A:Cys63.84
BrSG A:Cys64.47
BrC A:Cys64.72
BrCA A:Cys64.22
BrN A:Glu74.20
BrO1 A:2021341.59
BrBR A:2021340.00
BrO2 A:2021341.61

interactive model:


Bromine binding site 5 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 5 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 5 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 5 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1070, A: Hoh1097, A: Hoh1135, A: Hoh1174, A: Hoh1249, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1070, A: Hoh1097, A: Hoh1133, A: Hoh1171, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1069, A: Hoh1096, A: Hoh1132, A: Hoh1169, A: Hoh1288, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1069, A: Hoh1096, A: Hoh1129, A: Hoh1162, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1069, A: Hoh1096, A: Hoh1129, A: Hoh1161, A: Hoh1290, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1069, A: Hoh1096, A: Hoh1129, A: Hoh1160, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1069, A: Hoh1095, A: Hoh1127, A: Hoh1157, A: Hoh1277, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1069, A: Hoh1095, A: Hoh1127, A: Hoh1155, A: Hoh1263, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1069, A: Hoh1095, A: Hoh1127, A: Hoh1155, A: Hoh1255, A: Phe3, A: Ala11, A: Arg14, A: His15, A: Ser86, A: Asp87, A: Ile88, A: Thr89, A: 202135, A: Hoh1069, A: Hoh1095, A: Hoh1127, A: Hoh1155, A: Hoh1248, A: Hoh1293,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrO A:Hoh10703.65
BrO A:Hoh10974.53
BrO A:Hoh11354.37
BrO A:Hoh11744.17
BrO A:Hoh12493.59
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrO A:Hoh10703.65
BrO A:Hoh10974.53
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00
BrCZ A:Phe34.64
BrCB A:Ala114.52
BrCZ A:Arg144.65
BrNH2 A:Arg143.66
BrNH1 A:Arg144.92
BrNE2 A:His154.06
BrCD2 A:His154.80
BrO A:Ser864.24
BrN A:Asp874.93
BrCB A:Asp874.49
BrC A:Asp874.14
BrOD1 A:Asp873.81
BrCG A:Asp874.36
BrCA A:Asp873.82
BrN A:Ile883.43
BrCB A:Ile884.56
BrCD1 A:Ile884.84
BrCG2 A:Ile884.73
BrCG1 A:Ile883.88
BrCA A:Ile884.50
BrN A:Thr894.95
BrO1 A:2021351.67
BrBR A:2021350.00

interactive model:


Bromine binding site 6 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 6 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 6 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 6 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1267, A: Hoh1281, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1228, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1221, A: Hoh1284, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1213, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1210, A: Hoh1265, A: Hoh1294, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1205, A: Hoh1250, A: Hoh1268, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1197, A: Hoh1247, A: Hoh1269, A: Hoh1272, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1195, A: Hoh1259, A: Hoh1275, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1195, A: Hoh1251, A: Hoh1263, A: Hoh1275, A: Arg45, A: Arg68, A: 202136, A: Hoh1195, A: Hoh1255,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrO A:Hoh12673.26
BrO A:Hoh12814.84
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86
BrCD A:Arg454.99
BrNH2 A:Arg454.23
BrCZ A:Arg684.79
BrNH2 A:Arg684.13
BrNH1 A:Arg684.50
BrO1 A:2021361.56
BrBR A:2021360.00
BrO2 A:2021361.86

interactive model:


Bromine binding site 7 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 7 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 7 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 7 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1073, A: Hoh1220, A: Hoh1250, A: Hoh1273, A: Hoh1290, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1073, A: Hoh1215, A: Hoh1243, A: Hoh1261, A: Hoh1275, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1072, A: Hoh1209, A: Hoh1235, A: Hoh1259, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1072, A: Hoh1202, A: Hoh1227, A: Hoh1248, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1072, A: Hoh1200, A: Hoh1224, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1072, A: Hoh1197, A: Hoh1217, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1072, A: Hoh1125, A: Hoh1189, A: Hoh1208, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1072, A: Hoh1187, A: Hoh1206, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1072, A: Hoh1187, A: Hoh1206, A: Lys33, A: Phe34, A: Asn37, A: 202137, A: Hoh1020, A: Hoh1072, A: Hoh1187, A: Hoh1206, A: Hoh1289,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Hoh10733.95
BrO A:Hoh12204.57
BrO A:Hoh12504.55
BrO A:Hoh12731.97
BrO A:Hoh12902.16
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Hoh10733.95
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78
BrO A:Lys333.08
BrCE A:Lys334.21
BrCD A:Lys334.47
BrC A:Lys334.10
BrCG A:Lys334.70
BrNZ A:Lys334.52
BrO A:Phe344.61
BrN A:Phe344.73
BrCD1 A:Phe344.43
BrC A:Phe344.80
BrCE1 A:Phe344.92
BrCA A:Phe344.31
BrN A:Asn374.19
BrCB A:Asn373.58
BrND2 A:Asn373.74
BrOD1 A:Asn374.23
BrCG A:Asn373.60
BrCA A:Asn374.01
BrO1 A:2021371.29
BrBR A:2021370.00
BrO A:Hoh10202.78

interactive model:


Bromine binding site 8 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 8 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 8 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 8 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1048, A: Hoh1051, A: Hoh1090, A: Hoh1127, A: Hoh1144, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1048, A: Hoh1051, A: Hoh1090, A: Hoh1125, A: Hoh1141, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1047, A: Hoh1050, A: Hoh1089, A: Hoh1124, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1047, A: Hoh1050, A: Hoh1089, A: Hoh1293, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1047, A: Hoh1050, A: Hoh1089, A: Hoh1281, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1047, A: Hoh1050, A: Hoh1089, A: Hoh1281, A: Hoh1286, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1047, A: Hoh1050, A: Hoh1088, A: Hoh1258, A: Hoh1261, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1047, A: Hoh1050, A: Hoh1088, A: Hoh1253, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1047, A: Hoh1050, A: Hoh1088, A: Hoh1245, A: Hoh1276, A: Gln57, A: Ile58, A: Asn59, A: Trp63, A: Ile98, A: Ala107, A: Trp108, A: 202138, A: Hoh1047, A: Hoh1050, A: Hoh1088, A: Hoh1241, A: Hoh1265,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Hoh10484.54
BrO A:Hoh10513.87
BrO A:Hoh10902.96
BrO A:Hoh11271.87
BrO A:Hoh11443.45
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Hoh10484.54
BrO A:Hoh10513.87
BrO A:Hoh10902.96
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00
BrO A:Gln574.48
BrCA A:Ile584.83
BrN A:Asn594.45
BrCB A:Asn594.46
BrCD1 A:Trp634.51
BrNE1 A:Trp634.19
BrCD1 A:Ile984.59
BrCG2 A:Ile984.51
BrO A:Ala1073.59
BrC A:Ala1074.37
BrCB A:Ala1074.46
BrCA A:Ala1074.98
BrCD1 A:Trp1084.66
BrCE2 A:Trp1084.77
BrNE1 A:Trp1084.47
BrO1 A:2021381.61
BrBR A:2021380.00

interactive model:


Bromine binding site 9 out of 9 in 2d6b


Bromine binding site 9 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
stereopicture of Bromine binding site 9 out of 9 in 2d6b
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 9 of Bromine in the PDB 2d6b. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1187, A: Hoh1236, A: Hoh1260, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1183, A: Hoh1230, A: Hoh1282, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1180, A: Hoh1223, A: Hoh1287, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1173, A: Hoh1215, A: Hoh1267, A: Hoh1278, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1172, A: Hoh1212, A: Hoh1259, A: Hoh1270, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1171, A: Hoh1207, A: Hoh1245, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1168, A: Hoh1199, A: Hoh1267, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1166, A: Hoh1197, A: Hoh1257, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1166, A: Hoh1197, A: Hoh1249, A: Gly22, A: Ser24, A: Asn27, A: 202139, A: Hoh1166, A: Hoh1197,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Hoh11874.52
BrO A:Hoh12362.63
BrO A:Hoh12604.92
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00
BrO A:Gly224.57
BrN A:Ser244.07
BrCB A:Ser243.39
BrOG A:Ser243.08
BrCA A:Ser244.38
BrND2 A:Asn273.75
BrO1 A:2021391.72
BrBR A:2021390.00

interactive model:




© Copyright 2008-2012 by atomistry.com