Bromine in the structure of Monomeric Human Telomere Dna Tetraplex With 3+1 Strand Fold Topology, Two Edgewise Loops and Double-Chain Reversal Loop, 16 G Form 1, uc(Nmr), 10 Structures (pdb 2jsk)

The binding sites of Bromine atom in the structure of Monomeric Human Telomere Dna Tetraplex With 3+1 Strand Fold Topology, Two Edgewise Loops and Double-Chain Reversal Loop, 16 G Form 1, uc(Nmr), 10 Structures (pdb code 2jsk). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Bromine atom. The 2jsk structure was solved by V.V.KURYAVYI, A.T.PHAN, K.N.LUU, D.J.PATEL, with NMR in Solution technique. Bromine Binding Sites: Bromine binding site 1 out of 1 in 2jsk Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Bromine in the PDB 2jsk. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Bromine atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dt18, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dt18, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dt18, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, A: Dg10, A: Dg11, A: Bgm16, A: Dg17, conact list: Atom Atom Distance (A) Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 Br N2 A:Dg10 4.23 Br H21 A:Dg10 3.70 Br H22 A:Dg10 3.95 Br N2 A:Dg11 4.81 Br H22 A:Dg11 4.23 Br N9 A:Bgm16 2.90 Br H2' A:Bgm16 4.63 Br C8 A:Bgm16 1.90 Br C5 A:Bgm16 3.96 Br C4 A:Bgm16 4.04 Br H1' A:Bgm16 2.77 Br C1' A:Bgm16 3.35 Br N7 A:Bgm16 2.82 Br O4' A:Bgm16 4.15 Br C2' A:Bgm16 4.60 Br BR A:Bgm16 0.00 Br H5' A:Dg17 4.21 Br N9 A:Dg17 4.09 Br N3 A:Dg17 4.32 Br C8 A:Dg17 4.76 Br C5 A:Dg17 4.99 Br C4 A:Dg17 4.26 Br C4' A:Dg17 4.22 Br H1' A:Dg17 3.96 Br H4' A:Dg17 4.16 Br C1' A:Dg17 4.00 Br O4' A:Dg17 3.22 Br C5' A:Dg17 4.78 interactive model: